Роспотребнадзором в постоянном режиме осуществляется молекулярно-генетический мониторинг нуклеотидных последовательностей SARS-CoV-2, циркулирующих на территории РФ.

Центрами секвенирования Роспотребнадзора обеспечено проведение секвенирования положительных проб из всех субъектов РФ с последующей агрегацией в единой платформе расшифровки генома возбудителей инфекционных и паразитарных заболеваний VGARus, в которую загружено свыше 310 тыс. геномных последовательностей SARS-CoV-2 полученных в результате полногеномного и фрагментного секвенирования, в том числе 25 тыс. сиквенсов с января 2024 года.

По результатам проведенного молекулярно-генетического мониторинга последовательностей SARS-CoV-2 в настоящее время на территории РФ доминирующим вариантами являются JN.1 – 88%, как и в ряде других стран (США, Великобритания, Канада, Китай).

Вместе с тем, согласно международной базы данных GISAID, отмечается рост новой линии KP.2, относящейся к вариантам «FLiRT», в странах мира с 22 апреля. Тенденция к росту его доли относительно всех случаев постоянна на территории США (доля KP.2 достигла 11%) и Великобритании (доля KP.2 достигла 21%), в то время как в других странах эта тенденция переменна. По предварительным данным KP.2 может стать доминирующей линией во всем мире. Хотя недавнее исследование Японии, показало, что KP.2 менее заразен, чем JN.1: инфекционность КР.2 значительно (в 10,5 раза) ниже, чем у JN.1.

Варианты «FLiRT» являются дальними родственниками доминирующего варианта JN.1, все они принадлежат к семейству Omicron. Характерными симптомами для заболевания, вызванного вариантом «FLiRT» являются: лихорадка, кашель, заложенность носа или насморк, боль в горле и потеря вкуса или обоняния.

В настоящее время на территории РФ не обнаружено ни одной последовательности вариантов «FLiRT», в т.ч. KP.2.